土壤确诊还应检查土壤外表。该办法是将患病植物的地步与正常植物的邻近土壤地步进行比较，以检查是否存在差异。如果是盐碱损害，则在一般植物病害区的地块外表会有更多的盐分累积或显着的盐分偏移，并可以初步确认确诊。但是，对于土壤营养，植物表现出缺少某些营养或中毒的症状。肉眼判断是不行，有症状区域的土壤外表与正常区域之间没有差异。
确诊时，不仅是农作物的地上部分和土壤外表，还包括农作物的地下部分的症状和土壤情况，即从农作物和土壤中剖析病因。从总体上讲，更正确地获得了土壤与农作物之间的生理和谐关系。如土壤排水不良，通透性差，土壤中的有毒物质容易积聚在表层，一般农作物的根系又小又短。
在这种情况下，即使少量的新根是白色或棕色，而大多数根是黑色或烂了，整个农作物也会显得软弱或枯萎。当土壤枯燥时，根部吸收水分进入深层土壤，并且根部散布较深。当土壤外表潮湿时，土壤温度较低。但是，根系很短，并且大部分散布在表层。只有质地轻浮或深耕的土壤和根系才更均匀地散布。侧根很多，表皮润滑且无弯曲变形。 由上可知，作物根系的生态变化是土壤某些特征的客观反应，是土壤确诊的重要方面。
